O Berkut-UFA é um clube de futebol russo com sede em Ufa, Bascortostão. Eles competem no Campeonato Russo de Futebol Profissional, a terceira divisão do futebol russo.
O clube foi fundado em 2008 e é o sucessor do clube FC Ufa, que foi dissolvido em 2005. O Berkut-UFA estreou na Segunda Divisão Russa em 2009 e terminou em 14º lugar. Em 2010, eles terminaram em 12º lugar e, em 2011, em 11º lugar.
Na temporada 2012-13, o Berkut-UFA terminou em quinto lugar e se classificou para os playoffs de promoção à Primeira Divisão Russa. Eles derrotaram o FC Tyumen na primeira rodada, mas perderam para o FC Neftekhimik Nizhnekamsk na segunda rodada.
Na temporada 2013-14, o Berkut-UFA terminou em terceiro lugar e se classificou novamente para os playoffs de promoção. Eles derrotaram o FC Irtysh Omsk na primeira rodada, mas perderam para o FC Sibir Novosibirsk na segunda rodada.
Na temporada 2014-15, o Berkut-UFA terminou em oitavo lugar. Na temporada 2015-16, eles terminaram em quarto lugar e se classificaram para os playoffs de promoção. Eles derrotaram o FC Yenisey Krasnoyarsk na primeira rodada, mas perderam para o FC SKA-Khabarovsk na segunda rodada.
Na temporada 2016-17, o Berkut-UFA terminou em terceiro lugar e se classificou novamente para os playoffs de promoção. Eles derrotaram o FC Irtysh Omsk na primeira rodada, mas perderam para o FC Tyumen na segunda rodada.
Na temporada 2017-18, o Berkut-UFA terminou em sétimo lugar. Na temporada 2018-19, eles terminaram em sexto lugar. Na temporada 2019-20, eles terminaram em quinto lugar.