Istanbulspor AS Sub21

Foi fundado por estudantes do Ensino Médio de Istambul em 1926, sendo um dos primeiros clubes surgidos no período desde a proclamação da república na Turquia. Logo na temporada 1931–32, venceu a Liga de Istambul e sagrou-se também campeão Campeonato Turco Amador em 1932.

Até 1990, o clube foi gerido pela Fundação das Escolas de Ensino Médio de Istambul. Durante esse período, o İstanbulspor foi rebaixado para a Segunda Divisão e promovido novamente para a Primeira Divisão por diversas vezes. Também foi rebaixado para as Ligas Regionais Amadoras na temporada 1978–79, onde jogou por duas temporadas. Na temporada 1983–84, foi novamente rebaixado para a Terceira Divisão. Em 1990, a Uzan Holding, liderada por seu CEO Cem Uzan, comprou o clube e rebatizou-o para İstanbulspor A.Ş. Depois disso, o clube recebu um vultoso investimento inicial que lhe permitiu retonar à Primeira Divisão na temporada 1994–95. O İstanbulspor se tornou novamente um dos clubes de maior sucesso no país na metade final dos anos 1990, fazendo recorrentes boas campanhas, como a 4.ª colocação no Campeonato Turco da temporada 1997–98, as semifinais da Taça Intertoto da UEFA em 1997 e a 2.ª rodada dos playoffs da Copa da UEFA de 1998–99. Entretanto, a Uzan Holding retirou seu investimento do clube em 2001 e o İstanbulspor adentrou o novo século em grave crise financeira, terminando a Süper Lig de 2002–03 numa modesta 9.ª colocação, longe da zona de classificação para as competições europeias.

Em 2003, o governo turco decidiu intervir na delicada situação financeira do clube. Tal intervenção, no entanto, não conseguiu impedir o rebaixamento do İstanbulspor para a Segunda Divisão na temporada 2004–05. Em 2006, foi revendido para a Marmara Spor Faaliyetleri San. ve Tic. A.Ş, de propriedade do ex-jogador e empresário turco Saffet Sancaklı por 3 250 000 ₺. Em 2007, Ömer Sarıalioğlu, também empresário turco, comprou o clube, convertendo-o para o seu atual formato como sociedade anônima.

O İstanbulspor ficou durante duas temporadas tentando se salvar do rebaixamento para a Terceira Divisão: conseguiu se salvar na temporada 2007–08 ao terminar na 6.ª colocação do Grupo 3, mas não obteve a mesma sorte na temporada seguinte (2008–09), terminando na última colocação do mesmo Grupo 3. A má fase prosseguiu com o clube sendo rebaixado para a Quarta Divisão na temporada seguinte (2009–10). Nas temporadas seguintes, porém, passou por um processo de reestruturação interna que lhe permitiu conquistar a TFF 3. Lig na temporada 2014–15 e a TFF 2. Lig na temporada 2016–17. Desde a temporada 2017–18 disputa a TFF 1. Lig, divisão de acesso para a Süper Lig.