O FK Ilbirs Bishkek-2 é um clube de futebol de Kirguistão baseado em Bishkek. O clube foi fundado em 2003 como um time reserva do FK Ilbirs Bishkek, disputando a Primeira Liga até 2013.
Em 2014, o FK Ilbirs Bishkek-2 se tornou um clube independente e ingressou na Liga Superior de Futebol do Quirguistão, a primeira divisão do futebol quirguiz. O clube terminou em 10º lugar na temporada inaugural e em 9º lugar na temporada de 2015. Em 2016, o FK Ilbirs Bishkek-2 foi rebaixado para a Primeira Liga, após terminar em 11º lugar na classificação.
O FK Ilbirs Bishkek-2 retornou à Liga Superior em 2018, após vencer a Primeira Liga. O clube terminou em 7º lugar na temporada e em 9º lugar na temporada de 2019. Em 2020, o FK Ilbirs Bishkek-2 foi rebaixado novamente para a Primeira Liga, após terminar em 9º lugar na classificação.
O FK Ilbirs Bishkek-2 foi campeão da Primeira Liga em 2021 e retornou à Liga Superior para a temporada de 2022. O clube terminou em 8º lugar na classificação.
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