O Querétaro Fútbol Club Sub20 é uma equipe de futebol mexicana com sede em Santiago de Querétaro, Querétaro. Atua como filial da divisão juvenil do Querétaro Fútbol Club, da Liga MX.

O Querétaro Sub20 joga seus jogos em casa no Estádio Olímpico, compartilhando-o com a equipe principal, o Querétaro Fútbol Club. As cores do time são azul e preto, as mesmas da equipe principal.

O Querétaro Sub20 foi fundado em 2012 e desde então tem competido na Liga MX Sub-20, a divisão juvenil da Liga MX. O clube tem sido uma das equipes mais competitivas da liga, tendo vencido o campeonato duas vezes, em 2015 e 2019.

O Querétaro Sub20 também teve sucesso em outras competições nacionais juvenis, tendo vencido a Copa MX Sub-20 uma vez, em 2017. O clube também participou de competições internacionais juvenis, como a Liga dos Campeões da CONCACAF Sub-20, a qual venceu em 2018.

O Querétaro Sub20 é uma equipe jovem e talentosa, com vários jogadores que já foram promovidos para a equipe principal do Querétaro Fútbol Club. O clube é visto como uma das principais equipes de desenvolvimento de jogadores jovens no México.