Yokohama FC (em japonês, 横浜) é um clube profissional de futebol do Japão, com sede na cidade de Yokohama. Joga atualmente na J-League, a 1ª Divisão do Campeonato Japonês.
O Yokohama FC surgiu em 1999 por dissidentes do Yokohama Flügels, extinto um ano antes. Descontentes com a hipótese de torcerem para o rival local Yokohama F. Marinos, resolveram criar uma nova agremiação, que não pode usar o nome Flügels, por este passar a ser de propriedade do Marinos.
Inicialmente ocuparia a vaga do Flügels, mas a J. League rechaçou a proposta. Pierre Littbarski, ex-jogador da Seleção Alemã, se interessou em comandar a nova equipe ao saber da história do Yokohama FC e do apoio dos torcedores, enquanto Yasuhiko Okudera, primeiro japonês a atuar profissionalmente no futebol europeu, seria o presidente. Em seus quatro primeiros anos na J. League, o clube não teve resultado superior a não ser o 8º lugar em 2004. Em seguida contratou jogadores experientes, como Shoji Jo, Motohiro Yamaguchi e Kazuyoshi Miura, todos em fase final de carreira - Kazu é o único em atividade, pois Jo e Yamaguchi pararam em 2007. A estratégia deu certo, e o Yokohama FC volta à Primeira Divisão em 2006.
Mas a primeira passagem da equipe na elite do futebol japonês não deu resultado, e terminaria com o rebaixamento à J-2, onde permaneceu até 2019, quando conquistou o acesso à J1 de 2020 com 23 vitórias, 10 empates e 9 derrotas, além de ter feito 66 gols - destes, 18 foram do norueguês Ibba Laajab. Além de Kazu, outros 14 jogadores com 30 anos ou mais integravam o elenco (destaque para Shunsuke Nakamura, Daisuke Matsui e Leandro Domingues).